公募中
掲載日：2026/08/01
令和8年度 東京都医療機関電子カルテ導入支援補助金
上限金額
未設定
申請期限
2026年10月30日
東京都
医療機関診療情報デジタル導入支援事業
公募開始:2026/04/14～
※募集期間内であっても、募集を締め切っている場合があります。
紹介動画
目的
東京都内の病院や医科診療所を対象に、電子カルテシステムの新規導入に向けた計画策定やコスト算出等のコンサルタント費用を補助します。医療機関のデジタル化を初期段階から支援することで、施設間での円滑な情報共有や連携を促進し、地域医療全体の質向上と医療DXの推進を図ることを目的としています。
申請スケジュール
本事業の申請は、原則として補助金申請システム「jGrants」を利用した電子申請となります。GビズIDの取得など、事前の準備をお願いいたします。システムの利用が困難な場合は、事前に事務局までご相談ください。
- 申請受付期間
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- 公募開始：2026年04月15日
- 申請締切：2026年10月30日
補助金申請システム「jGrants」を通じて必要書類を提出してください。期間内に適切な事業計画書等の提出が必要となります。
- 審査・交付決定
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- 交付決定時期：2026年08月以降
提出された書類に基づき、東京都が厳正な審査を行います。審査の結果、適当と認められた場合に交付決定通知が送付されます。※申請が多数の場合、時期が前後する可能性があります。
- 事業実施期間
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- 事業完了期限：2027年03月31日
【重要】契約・発注は必ず「交付決定通知後」に行ってください。通知前の契約は補助対象外となります。
- 原則として一般競争入札または指名競争入札での契約が必要です。
- 年度末（2027年3月31日）までに、納品と業者への支払いをすべて完了させてください。
- 補助金の支払い
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- 支払い予定：2027年05月頃
事業完了後の実績報告と内容確認を経て、補助金が支払われます。
対象となる事業
東京都内の医療機関が新たに電子カルテシステムを導入する際の支援を行い、医療情報の共有・連携強化および医療DXの推進を目的とする事業です。
■令和８年度医療機関診療情報デジタル導入支援事業
医療機関が新たに電子カルテシステムを導入することを検討する上で必要となる「調整業務」に係るコンサルタント活用等の費用を補助します。
＜補助対象者＞
- 東京都内で病院（病床配分決定を受けて新規に開設する病院を含む）を開設する者
- 東京都内で医科診療所を開設する者
- 東京都知事が適当と認めた医療機関
＜補助対象経費＞
- 電子カルテシステムを新たに導入することを検討する上で必要となる「調整業務」に係るコンサルタント費用
- 電子カルテシステム導入計画の策定費用
- 導入にかかるコストの算出費用
＜補助事業実施期間＞
- 令和８年度（交付決定通知後から令和９年３月３１日まで）
＜補助上限額・補助率＞
- 基準額：1医療機関あたり1,000千円（100万円）
- 200床以上の病院：補助率 2分の1
- 200床未満の病院および医科診療所：補助率 4分の3
＜導入システムの技術要件＞
- 病院に導入するシステムは、厚生労働省標準規格「SS-MIX2ストレージ」または「HL7 FHIR記述仕様」のいずれかに出力できる機能を持つこと
- 「電子カルテ情報共有サービス」などの全国医療情報プラットフォームへの接続について検討すること
▼補助対象外となる事業
以下の機関、経費、および状況に該当する場合は補助の対象外となります。
- 補助対象外となる機関
- 国、地方自治法に規定される地方公共団体
- 地方独立行政法人、特定独立行政法人、独立行政法人
- 国立大学法人
- 健康保険法に規定される保険医療機関ではない診療所
- 過去に本補助金の交付を受けたことがある医療機関
- 東京都暴力団排除条例に規定される暴力団や暴力団員等に該当する者がいる法人、団体
- 補助対象外となる経費・事業内容
- 既に導入済みの電子カルテシステムを「更新」するための費用
- 電子カルテシステムとは別の「部門システム」を導入することに関する費用
- 国や他の地方公共団体から同様の補助金を受けている経費（二重受給）
- 事務手続き上の対象外要件
- 交付決定通知前に開始（契約・入札）された事業
- 年度内（令和９年３月末）に完了（納品および支払い完了）しない事業
令和８年度医療機関診療情報デジタル導入支援事業
■電子カルテシステム導入支援
＜補助対象経費＞
- 電子カルテシステムを新たに導入する検討に際して必要となる調整業務に係るコンサルタント費用
- 電子カルテシステム導入計画の策定
- 導入コストの算出
＜基準額・補助率＞
| 医療機関の種別・規模 | 基準額 | 補助率 |
|---|---|---|
| 200床以上の病院 | 1,000千円 | 1/2 |
| 200床未満の病院および医科診療所 | 1,000千円 | 3/4 |
＜主な補助要件＞
- 東京都内の病院または医科診療所であること
- 電子カルテシステムを新たに導入すること
- 病院の場合、SS-MIX2ストレージまたはHL7 FHIR記述仕様のいずれかに出力可能であること
- 全国医療情報プラットフォームへの接続について検討すること
- 交付決定通知後に契約締結・事業開始すること
- 令和9年3月末までに事業（支払い含む）を完了すること
対象者の詳細
補助対象となる医療機関
東京都内に所在し、東京都知事によって適当と認められる以下の医療機関を対象とします。
-
病院を開設する者
病床配分決定を受けて新規に病院を開設する者を含みます
■補助対象外となる医療機関・団体
上記の基本要件を満たす場合でも、以下のいずれかに該当する医療機関や団体は補助の対象外となります。
- 国の機関（国が設置・運営する医療機関）
- 地方公共団体（地方自治法第1条の3に規定される団体）
- 地方独立行政法人等（地方独立行政法人法第2条第1項・第2項に規定される法人）
- 独立行政法人等（独立行政法人通則法第2条第1項・第2項に規定される法人）
- 国立大学法人（国立大学法人法第2条第1項に規定される法人）
- 保険医療機関ではない診療所（健康保険法第63条第3項第1号に規定される保険医療機関ではない診療所）
- 過去に本補助金を受給した医療機関
- 暴力団（東京都暴力団排除条例第2条第2号に規定されるもの）
- 暴力団関係者（代表者、役員、従業者等に暴力団員または関係者が含まれる団体）
※本補助金は、主に民間の医療機関が新たに電子カルテシステムを導入する際の支援を目的としています。
公式サイト
- 公式ホームページ
- https://www.hokeniryo.metro.tokyo.lg.jp/iryo/jigyo/h_gaiyou/digital_dounyu.html
- 東京都公式サイト（総合）
- https://www.metro.tokyo.lg.jp/
- My TOKYO（東京都公式ポータルサイト）
- https://www.my.metro.tokyo.lg.jp/
- 東京都防災ホームページ
- https://www.bousai.metro.tokyo.lg.jp/
- 東京都 政策企画局 公式ホームページ
- https://www.seisakukikaku.metro.tokyo.lg.jp/
- 東京都 子供政策連携室 公式ホームページ
- https://www.kodomoseisaku.metro.tokyo.lg.jp/
- 東京都 総務局 公式ホームページ
- https://www.soumu.metro.tokyo.lg.jp/
- 東京都 財務局 公式ホームページ
- https://www.zaimu.metro.tokyo.lg.jp/
- 東京都 デジタルサービス局 公式ホームページ
- https://www.digitalservice.metro.tokyo.lg.jp/
- 東京都 主税局 公式ホームページ
- https://www.tax.metro.tokyo.lg.jp/
- 東京都 生活文化局 公式ホームページ
- https://www.seikatubunka.metro.tokyo.lg.jp/
- 東京都 都民安全総合対策本部 公式ホームページ
- https://www.tomin-anzen.metro.tokyo.lg.jp/
- 東京都 スポーツ推進本部 公式ホームページ
- https://www.sports-tokyo-info.metro.tokyo.lg.jp/
- 東京都 都市整備局 公式ホームページ
- https://www.toshiseibi.metro.tokyo.lg.jp/
- 東京都 住宅政策本部 公式ホームページ
- https://www.juutakuseisaku.metro.tokyo.lg.jp/
- 東京都 環境局 公式ホームページ
- https://www.kankyo.metro.tokyo.lg.jp/
- 東京都 福祉局 公式ホームページ
- https://www.fukushi.metro.tokyo.lg.jp/
- 東京都 保健医療局 公式ホームページ
- https://www.hokeniryo.metro.tokyo.lg.jp/
- 東京都 産業労働局 公式ホームページ
- https://www.sangyo-rodo.metro.tokyo.lg.jp/
- 東京都 中央卸売市場 公式ホームページ
- https://www.shijou.metro.tokyo.lg.jp/
- 東京都 スタートアップ戦略推進本部 公式ホームページ
- https://www.startupandglobalfinancialcity.metro.tokyo.lg.jp/
- 東京都 建設局 公式ホームページ
- https://www.kensetsu.metro.tokyo.lg.jp/
- 東京都 港湾局 公式ホームページ
- https://www.kouwan.metro.tokyo.lg.jp/
- 東京都 会計管理局 公式ホームページ
- https://www.kaikeikanri.metro.tokyo.lg.jp/
- 東京都 交通局 公式ホームページ
- https://www.kotsu.metro.tokyo.jp/
- 東京都 水道局 公式ホームページ
- https://www.waterworks.metro.tokyo.lg.jp/
- 東京都 下水道局 公式ホームページ
- https://www.gesui.metro.tokyo.lg.jp/
- 東京都 教育委員会（教育庁） 公式ホームページ
- https://www.kyoiku.metro.tokyo.lg.jp/
- 東京都 選挙管理委員会事務局 公式ホームページ
- https://www.senkyo.metro.tokyo.lg.jp/
- 東京都 人事委員会事務局 公式ホームページ
- https://www.saiyou.metro.tokyo.lg.jp/
- 東京都 監査事務局 公式ホームページ
- https://www.kansa.metro.tokyo.lg.jp/
- 東京都 公安委員会 公式ホームページ
- https://www.kouaniinkai.metro.tokyo.lg.jp/
- 警視庁 公式ホームページ
- https://www.keishicho.metro.tokyo.lg.jp/
- 東京都 労働委員会 公式ホームページ
- https://www.toroui.metro.tokyo.lg.jp/
- 東京都 収用委員会 公式ホームページ
- https://www.shuyou.metro.tokyo.lg.jp/
- 東京都議会（議会局） 公式ホームページ
- https://www.gikai.metro.tokyo.lg.jp/
- 医療機関診療情報デジタル導入支援事業実施要綱（2026/04/02） （PDF）
- https://www.hokeniryo.metro.tokyo.lg.jp/documents/d/hokeniryo/2026-04-02-201435-075
- 医療機関診療情報デジタル導入支援事業補助金交付要綱（2026/04/02） （PDF）
- https://www.hokeniryo.metro.tokyo.lg.jp/documents/d/hokeniryo/2026-04-02-201350-111
- jGrants（令和８年度医療機関診療情報デジタル導入支援事業）
- https://www.jgrants-portal.go.jp/subsidy/a0WJ200000CDY6uMAH
- 医療機関診療情報デジタル導入支援事業 補助金申請手続の手引（2026/04/02） （PDF）
- https://www.hokeniryo.metro.tokyo.lg.jp/documents/d/hokeniryo/2026-04-02-210351-989
- 医療機関診療情報デジタル導入支援事業補助金に係る交付申請書（2026/04/02） （PDF）
- https://www.hokeniryo.metro.tokyo.lg.jp/documents/d/hokeniryo/2026-04-02-201510-258
- 医療機関診療情報デジタル導入支援事業計画書（2026/04/02） （PDF）
- https://www.hokeniryo.metro.tokyo.lg.jp/documents/d/hokeniryo/2026-04-02-201547-410
- 経費所要額調（2026/04/02） （PDF）
- https://www.hokeniryo.metro.tokyo.lg.jp/documents/d/hokeniryo/2026-04-02-201607-991
- 歳入歳出予算書（見込書）抄本 （PDF）
- https://www.hokeniryo.metro.tokyo.lg.jp/documents/d/hokeniryo/sainyuu
- 民間医療機関向け補助金 Q&A
- https://www.hokeniryo.metro.tokyo.lg.jp/iryo/jigyo/h_gaiyou/qa
- 保健医療局医療政策部医療施設等施設・設備整備費等補助金に係る契約手続基準（2026/04/07） （PDF）
- https://www.hokeniryo.metro.tokyo.lg.jp/documents/d/hokeniryo/2026-04-07-095025-189
- 事業者向け「申請・届出」カテゴリ検索（東京都公式サイト）
- https://www.metro.tokyo.lg.jp/search?keyword=&category=163908
- 事業者向け「申請・届出」カテゴリ検索（My TOKYO）
- https://www.my.metro.tokyo.lg.jp/business/search/?category=188529
令和8年度医療機関診療情報デジタル導入支援事業の申請は、原則としてjGrantsによるオンライン申請となります。申請期間は令和8年4月15日から令和8年10月30日までです。詳細は各要綱や手引をご確認ください。
お問合せ窓口
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TEL：03-5321-1111 (代表)
受付窓口
東京都庁
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東京都医療DX推進事業補助金事務局
TEL：050-3816-2607
Email：tokyo-dx@saison-psp.co.jp
「令和8年度医療機関診療情報デジタル導入支援事業」に関する申請や内容について。電話番号は令和8年4月15日から開設。外部事業者に委託して運営。jGrantsの利用が難しい場合は相談可能。
- 募集期間内であっても、予算上限に達し、募集を締め切っている場合がありますので、あらかじめご了承ください。
- 施策のご利用にあたっては、公式のお問合せ窓口までお問い合わせください。